הסדרה תחזור לתקופת הניינטיז האיקונית ותעקוב אחר חבורת המוטנטים שמשתמשים בכוחות המופלאים בהם בורכו כדי להגן על העולם ששונא ומפחד מהם. הם מאותגרים, ועל כן נאלצים להתמודד עם עתיד חדש, מסוכן ובלתי צפוי. הפרקים החדשים יתרחשו מיד לאחר פרק הסיום משנת 1997, בו פרופסור אקסבייר מת, ובעצם ישמשו כמעין עונה שישית מאוחרת לסדרה המקורית.